BIOINFORMATICS

Anno accademico
2019/2020 Programmi anni precedenti
Titolo corso in inglese
BIOINFORMATICS
Codice insegnamento
CM0190 (AF:274869 AR:166146)
Modalità
In presenza
Crediti formativi universitari
6
Livello laurea
Laurea magistrale (DM270)
Settore scientifico disciplinare
INF/01
Periodo
I Semestre
Anno corso
2
Sede
VENEZIA
Spazio Moodle
Link allo spazio del corso
Il corso e' una introduzione alla Bioinformatica, disciplina che cerca di fornire soluzioni computazionali a problemi posti dalla biologia molecolare e dalla genetica.
In particolare si considerano problemi e soluzioni nell'ambito dell'analisi di sequenze biologiche quali DNA e proteine.
Nell'ambito della Systems Biology verranno illustrati alcuni esempi di sistemi biologici rappresentati con modelli e strumenti tipici dell'informatica.
Conoscenza e comprensione.

Lo studente avrà acquisito padronanza della terminologia scientifica specifica.
Avrà acquisito una introduzione alla bioinformatica e ne avrà compreso le potenzialità e la complessità.
Sarà in grado di riconoscere e comprendere le soluzioni informatiche ai problemi biologici trattati.


Capacità di applicare conoscenza e comprensione.

Lo studente sarà in grado di svolgere esercizi finalizzati ad applicare le conoscenze acquisite nei vari argomenti del corso.
Sarà in grado di svolgere, se richiesto, un piccolo progetto software per la soluzione di un problema biologico.

Conoscenze di algoritmi e complessità computazionale.
Conoscenze di linguaggi formali.
1. Nozioni di biologia molecolare: DNA, RNA, proteine, cellula.
2. Confronto di sequenze: Pattern matching esatto; Suffix tree; Suffix array; Allinamento a coppie; Allineamento multiplo.
3. Alberi filogenetici: inferenza e confronto.
4. Sequenziamento genomico: tecnologie e strategie.
5. Biologia dei sistemi: un problema e una sua soluzione.
6. Modelli di sequenze: Grammatiche e automi con pesi e probabilistici; HMM.
7. Modellazione e folding delle proteine.
Materiale fornito dal docente.
Esame scritto composto da domande ed esercizi sul programma svolto.
In aggiunta, approfondimento/progetto assegnato dal docente.
Il corso si avvale di didattica classica di tipo frontale.
Inglese
Il materiale del corso sara' disponibile sul sito
http://moodle.unive.it
scritto e orale
Programma definitivo.
Data ultima modifica programma: 23/07/2019